Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms