Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms