Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DmdP11531 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DmdP11531 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DmdP11531 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DmdP11531 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms