Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms