Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms