Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb5P09079 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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