Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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