Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnfP06804 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnfP06804 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnfP06804 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnfP06804 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms