Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms