Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01755 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01755 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01755 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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