Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01667 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01667 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01667 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01667 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms