Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01648 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01648 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01648 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01648 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01648 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01648 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01648 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms