Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms