Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda1O88958 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms