Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms