Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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