Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AurkcO88445 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms