Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pknox1O70477 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms