Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtssO70370 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtssO70370 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms