Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms