Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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