Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja1O55176 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja1O55176 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja1O55176 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms