Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms