Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sept7O55131 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sept7O55131 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sept7O55131 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sept7O55131 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sept7O55131 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sept7O55131 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms