Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms