Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms