Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a2O54833 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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