Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc4O35988 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms