Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FxnO35943 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FxnO35943 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms