Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd2O35927 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms