Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cited2O35740 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms