Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a6O35544 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms