Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms