Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6bO35451 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms