Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms