Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kpna4O35343 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms