Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms