Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M9O19442 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M9O19442 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms