Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PbsnO08976 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PbsnO08976 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PbsnO08976 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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PbsnO08976 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms