Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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