Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms