Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm7980L7N471 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm7980L7N471 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm7980L7N471 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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