Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms