Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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