Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Smim22J3QP37 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim22J3QP37 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Smim22J3QP37 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms