Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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