Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lipo1J3QME6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms