Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem200cJ3QK46 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms