Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
7530416G11RikJ3QJX6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms