Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms